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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  40 lines
  1. **********************
  2. * Colipase signature *
  3. **********************
  4.  
  5. Colipase [1,2,3] is  a  protein   that  functions as a cofactor for pancreatic
  6. lipase, with  which  it  forms  a stoichiometric complex. It also binds to the
  7. bile-salt covered triacylglycerol interface thus allowing the enzyme to anchor
  8. itself to the water-lipid interface.
  9.  
  10. As shown  in  the  following  schematic  representation,  colipase  is a small
  11. protein of approximately 100 amino-acid residues with five conserved disulfide
  12. bonds.
  13.  
  14.                            +--------+
  15.                         +--|--+     |    +----------+
  16.                         |  |  |     |    |   *****  |
  17.                 xxxxxxxxCxxCxCCxxxxxCxxxxCxxxxxCxCxxCxxxxxxxxCxxxx
  18.                              |                 | |           |
  19.                              +-----------------+ +-----------+
  20.  
  21. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  22. '*': position of the pattern.
  23.  
  24. As a signature pattern for this  protein, we chose a region which includes two
  25. of  the cysteines involved  in  disulfide bonds,  as  well  as  three tyrosine
  26. residues which seem to be involved in the interfacial binding.
  27.  
  28. -Consensus pattern: Y-x(2)-Y-Y-x-C-x-C
  29.                     [The two C's are involved in disulfide bonds]
  30. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  31. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  32. -Last update: June 1994 / Text revised.
  33.  
  34. [ 1] Erlanson-Albertsson C.
  35.      Biochim. Biophys. Acta 1125:1-7(1992).
  36. [ 2] Chapus C., Rovery M., Sarda L., Verger R.
  37.      Biochimie 70:1223-1234(1988).
  38. [ 3] van Tilbeurgh H., Sarda L., Verger R., Cambillau C.
  39.      Nature 359:159-162(1992).
  40.